科技日?qǐng)?bào)北京12月17日電 (記者張夢(mèng)然)英國(guó)《自然》雜志17日發(fā)布了人類(lèi)細(xì)胞核內(nèi)染色體的詳細(xì)圖譜。這一資源為深入理解人類(lèi)DNA物理結(jié)構(gòu)和生物表達(dá)的關(guān)聯(lián)提供了基礎(chǔ)。
人類(lèi)染色體的三維組織結(jié)構(gòu),對(duì)于協(xié)調(diào)遺傳物質(zhì)調(diào)控生物反應(yīng)過(guò)程起著重要作用。DNA纏繞組蛋白形成名為染色質(zhì)的復(fù)合體,存儲(chǔ)在細(xì)胞核內(nèi)。大量染色質(zhì)位點(diǎn)可通過(guò)生物化學(xué)修飾來(lái)調(diào)控基因表達(dá)。繪制這一三維結(jié)構(gòu)及其如何隨時(shí)間(第四維度)而改變的工作,被稱(chēng)為4D核組學(xué)。
鑒于細(xì)胞核結(jié)構(gòu)如何在不同的時(shí)間尺度上重新組構(gòu)尚未解釋清楚,一個(gè)重要原因是研究工具未能及時(shí)跟上。美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院共同基金于2015年啟動(dòng)了“4D核組計(jì)劃”,其目標(biāo)是開(kāi)發(fā)出研究核組織在空間和時(shí)間上的結(jié)構(gòu)和功能的技術(shù)。
此次,“4D核組計(jì)劃”團(tuán)隊(duì)之一、美國(guó)馬薩諸塞大學(xué)醫(yī)學(xué)院采用多種染色體捕獲技術(shù),分析兩類(lèi)細(xì)胞中的染色體組織:人類(lèi)胚胎干細(xì)胞和成纖維細(xì)胞(結(jié)締組織細(xì)胞)。他們?yōu)槊糠N細(xì)胞類(lèi)型編目了超過(guò)14萬(wàn)種染色質(zhì)環(huán)(DNA復(fù)合結(jié)構(gòu)),生成了單個(gè)基因的核環(huán)境模型,包括其與遠(yuǎn)側(cè)調(diào)控元件的潛在遠(yuǎn)距離相互作用。
通過(guò)整合不同方法的數(shù)據(jù)集,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)每種方法進(jìn)行了基準(zhǔn)測(cè)試,評(píng)估其在特定研究的用處。這項(xiàng)聯(lián)合研究還揭示了折疊染色質(zhì)的基本物理機(jī)制——譬如,染色質(zhì)的擠出和相分離,究竟是如何共同塑造了復(fù)雜的基因組三維結(jié)構(gòu)等問(wèn)題。結(jié)合這些數(shù)據(jù)集生成的空間模型,使轉(zhuǎn)錄和復(fù)制等遺傳過(guò)程能夠在染色質(zhì)的三維環(huán)境中得到定位。
研究團(tuán)隊(duì)表示,后續(xù)仍需要進(jìn)一步研究,以探索這些觀察到的結(jié)構(gòu)如何與單個(gè)基因功能相關(guān)聯(lián),以及這些成果是否能應(yīng)用于對(duì)抗遺傳疾病。
(責(zé)任編輯:蔡文斌)